Jan Szczypka jest absolwentem Wydziału Rzeźby Państwowej Wyższej Szkoły Sztuk Plastycznych (obecnie ASP) w Gdańsku. Dyplom w 1987 roku, nagrodzony 1. nagrodą na Ogólnopolskim Pokazie Dyplomów w warszawskiej Zachęcie. Wcześniej ukończył Państwowe Liceum Sztuk Plastycznych im. A. Kenara w Zakopanem.

Przez wiele lat był związany zawodowo z pracownią Medalierstwa i Małych Form Rzeźbiarskich gdańskiej ASP. Obecnie prowadzi Pracownię Podstaw Rzeźby i Technologię Metalu dla studentów Wydziału Rzeźby i Intermediów oraz Wydziału Wzornictwa. Zajmuje się przede wszystkim rzeźbą i medalierstwem. Swoje prace realizuje głównie w metalu, wciąż poszerzając wiedzę na temat odlewnictwa i traktując technologię jako dalszy ciąg procesu twórczego. Pracuje w brązie, cynku, aluminium, żeliwie. Ciągle poszukuje własnych rozwiązań formalnych, a także możliwości ekspresyjnych, fakturalnych i kolorystycznych metalu.

Uczestniczył w kilkudziesięciu wystawach, konkursach i sympozjach w Polsce i za granicą. Był wielokrotnie nagradzany. Sympozja rzeźbiarskie, którym towarzyszą wysokie temperatury związane z odlewnictwem, przeplata sympozjami rzeźby w śniegu. Zorganizował trzy edycje międzynarodowych konferencji poświęconych problematyce odlewnictwa artystycznego i 14 edycji Międzynarodowych Warsztatów Odlewniczych (2001–2014). Uczestniczyło w nich ponad 350 studentów i pedagogów z Polski, USA, Wielkiej Brytanii, Włoch, Grecji, Portugalii, Łotwy, Litwy, Ukrainy i Słowacji. Jest autorem pomnika Jana Heweliusza w Gdańsku, przed Ratuszem Starego Miasta.